<div dir="ltr"><div class="markdown-here-wrapper" style="font-family:'Courier New'"><p style="margin:1.2em 0px!important">Dear Pr. Geuzaine,</p>
<p style="margin:1.2em 0px!important">Thank you for your quick answer.</p>
<p style="margin:1.2em 0px!important">From an old svn clone, I have made an update (<code style="font-style:inherit;font-variant:inherit;font-weight:inherit;font-stretch:inherit;font-size:inherit;line-height:inherit;font-family:inherit;margin:0px 0.15em;padding:0px 0.15em;white-space:pre-wrap;border:1px solid rgb(234,234,234);border-radius:3px;display:inline;background-color:rgb(248,248,248)">svn up</code>) then a build from scratch.</p>
<p style="margin:1.2em 0px!important"><code style="font-style:inherit;font-variant:inherit;font-weight:inherit;font-stretch:inherit;font-size:inherit;line-height:inherit;font-family:inherit;margin:0px 0.15em;padding:0px 0.15em;white-space:pre-wrap;border:1px solid rgb(234,234,234);border-radius:3px;display:inline;background-color:rgb(248,248,248)">./gmsh -3 -part 12 ../demos/sphere.geo</code> runs like a charm now.</p>
<p style="margin:1.2em 0px!important">All the best,</p>
<p style="margin:1.2em 0px!important">VH.</p>
<div title="MDH:PGRpdiBjbGFzcz0iZ21haWxfZGVmYXVsdCIgc3R5bGU9ImZvbnQtZmFtaWx5OmNvdXJpZXIgbmV3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" style="height:0;width:0;max-height:0;max-width:0;overflow:hidden;font-size:0em;padding:0;margin:0">​</div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-05-19 14:11 GMT+02:00 Christophe Geuzaine <span dir="ltr"><<a href="mailto:cgeuzaine@ulg.ac.be" target="_blank">cgeuzaine@ulg.ac.be</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Dear Vincent,<br>
<br>
This should be fixed in the SVN version (or recent nightly snapshots). Give it a try and let us know.<br>
<br>
Christophe<br>
<div><div class="h5"><br>
> On 19 May 2016, at 12:10, Vincent Huber <<a href="mailto:vincent.huber@cemosis.fr">vincent.huber@cemosis.fr</a>> wrote:<br>
><br>
> Dear all,<br>
><br>
> I have compiled this <a href="http://gmsh.info/src/gmsh-2.12.0-source.tgz" rel="noreferrer" target="_blank">http://gmsh.info/src/gmsh-2.12.0-source.tgz</a><br>
> with<br>
><br>
> cmake \<br>
>   -DCMAKE_CXX_COMPILER=`which g++` \<br>
>   -DCMAKE_C_COMPILER=`which gcc` \<br>
>   -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/data/software/install/gmsh-<br>
> 2.12.0<br>
>  \<br>
>   -DCMAKE_BUILD_TYPE=release \<br>
>   -DENABLE_BUILD_LIB=ON \<br>
>   -DENABLE_BUILD_SHARED=ON \<br>
>   -DENABLE_BUILD_DYNAMIC=ON \<br>
>   -DENABLE_MPI=OFF \<br>
>   -DENABLE_MUMPS=OFF \<br>
>   -DENABLE_OPENMP=OFF  \<br>
>   ..<br>
><br>
> The logs are at the end of the mail.<br>
><br>
> I have meshed demos/sphere.geo with:<br>
><br>
> gmsh -3<br>
>  demos/sphere.geo<br>
><br>
> successfully.<br>
><br>
> problem here<br>
> the partition process goes wrong:<br>
><br>
> gmsh -3 -part 3<br>
>  demos/sphere.geo<br>
><br>
> (see logs at the end).<br>
><br>
> Please note I have successfully meshed and partitioned a mesh from the GUI.<br>
><br>
> All the best,<br>
><br>
> VH<br>
><br>
> CMake<br>
><br>
> -- Found Blas(ATLAS)<br>
> -- Found Lapack(ATLAS)<br>
> -- Found Mesh<br>
> -- Found Solver<br>
> -- Found Post<br>
> -- Found Plugins<br>
> -- Found Parser<br>
> -- Found Fltk<br>
> -- Using fltk-config script<br>
> for Fltk 1.3<br>
><br>
> -- Found NativeFileChooser<br>
> -- Found ONELAB<br>
> -- Found ONELABMetamodel<br>
> -- Found Jpeg<br>
> -- Found Zlib<br>
> -- Found Png<br>
> -- Found Mpeg<br>
> -- Found OpenGL<br>
> -- Found Ann<br>
> -- Found Bfgs<br>
> -- Found Cairo<br>
> -- Found DIntegration<br>
> -- Found OptHom<br>
> -- Found Kbipack<br>
> -- Found GMP<br>
> -- Found MathEx<br>
> -- Found Metis<br>
> -- Note: By including Metis you have to comply with Metis<br>
> ' special licensing requirements stated in contrib/Metis/README.txt.<br>
> -- Found Chaco<br>
> -- Found Voro3D<br>
> -- Found Blossom<br>
> -- Found Netgen<br>
> -- Found Bamg<br>
> -- System MMG3D not found: using contrib/mmg3d instead<br>
> -- Found Mmg3d<br>
> -- Found Tetgen(1.5)<br>
> -- Note: By including Tetgen you have to comply with Tetgen'<br>
> s special licensing requirements stated in<br>
>  contrib/Tetgen*/LICENSE.<br>
> -- System GMM not found: using contrib/gmm instead<br>
> -- Found Gmm<br>
> -- Found Taucs<br>
> -- Using PETSc dir: /data/software/install/petsc-<br>
> 3.6.3/openmpi-1.10.0<br>
><br>
> -- Using PETSc arch:<br>
> -- Found PETSc<br>
> -- Using SLEPc dir: /data/software/install/slepc-<br>
> 3.6.3/openmpi-1.10.0<br>
><br>
> -- Found SLEPc<br>
> -- Found OpenCascade<br>
> -- Found Salome<br>
> -- Found Dlopen<br>
> -- Found LinuxJoystick<br>
> --<br>
> -- Gmsh<br>
> 2.12.0 has been configured for<br>
>  Linux<br>
> --<br>
> --  * Build options: Ann Bamg Bfgs Blas(ATLAS) Blossom Cairo Chaco DIntegration Dlopen Fltk GMP Gmm Jpeg Kbipack Lapack(ATLAS) LinuxJoystick MathEx Mesh Metis Mmg3d Mpeg NativeFileChooser Netgen ONELAB ONELABMetamodel OpenCascade OpenGL OptHom PETSc Parser Plugins Png Post SLEPc Salome Solver Taucs Tetgen(<br>
> 1.5<br>
> ) Voro3D Zlib<br>
> --  * Build<br>
> type<br>
> : release<br>
> --  * C compiler: /data/software/install/gcc-<br>
> 4.9.0<br>
> /bin/gcc<br>
> --  * C++ compiler: /data/software/install/gcc-<br>
> 4.9.0<br>
> /bin/g++<br>
> --  * Install prefix: /data/software/install/gmsh-<br>
> 2.12.0<br>
><br>
> --<br>
> -- Configuring<br>
> done<br>
><br>
> -- Generating<br>
> done<br>
><br>
> -- Build files have been written to: /data/software/src/gmsh-<br>
> 2.12.0<br>
> -source/build<br>
><br>
> ​partitioning<br>
><br>
> Info : Running ‘gmsh -3 ./demos/sphere.geo -part 3’ [Gmsh 2.12.0, 1 node, max. 1 thread]<br>
> Info : Started on Thu May 19 12:06:01 2016<br>
> Info : Reading ‘./demos/sphere.geo’…<br>
> Info : Done reading ‘./demos/sphere.geo’<br>
> Info : Meshing 1D…<br>
> Info : Meshing curve 1 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 2 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 3 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 4 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 5 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 6 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 7 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 8 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 9 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 10 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 11 (Circle)<br>
> Info : Meshing curve 12 (Circle)<br>
> Info : Done meshing 1D (0.003091 s)<br>
> Info : Meshing 2D…<br>
> Info : Meshing surface 14 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 16 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 18 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 20 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 22 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 24 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 26 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Meshing surface 28 (Ruled surface, Frontal)<br>
> Info : Done meshing 2D (0.20296 s)<br>
> Info : Meshing 3D…<br>
> Info : Delaunay Meshing 1 volumes with 1 connected components<br>
> Info : Meshing volume 30 (Delaunay)<br>
> Delaunizing vertices…<br>
> Delaunay seconds: 0.527774<br>
> Creating surface mesh …<br>
> Surface mesh seconds: 0.004444<br>
> Recovering boundaries…<br>
> Boundary recovery seconds: 0.004269<br>
> Removing exterior tetrahedra …<br>
> Exterior tets removal seconds: 0.000612<br>
> Recovering Delaunayness…<br>
> Delaunay recovery seconds: 0.146909<br>
> Optimizing mesh…<br>
> Optimization seconds: 0.00224<br>
><br>
> Writing nodes.<br>
> Writing elements.<br>
> Writing faces.<br>
> Writing edges.<br>
><br>
> Output seconds: 0.002485<br>
> Total running seconds: 0.68894<br>
><br>
> Statistics:<br>
><br>
> Input points: 1603<br>
> Input facets: 3202<br>
> Input segments: 4803<br>
> Input holes: 0<br>
> Input regions: 0<br>
><br>
> Mesh points: 1603<br>
> Mesh tetrahedra: 4448<br>
> Mesh faces: 10497<br>
> Mesh edges: 7651<br>
> Mesh faces on exterior boundary: 3202<br>
> Mesh edges on exterior boundary: 4803<br>
> Mesh faces on input facets: 3202<br>
> Mesh edges on input segments: 4803<br>
><br>
> Info : 1603 points 7651 edges and 3202 faces in the initial mesh<br>
> Info : Found region 30<br>
> Info : 0 points created - Worst tet radius is 10.7622 (PTS removed 0 0)<br>
> Info : 3D point insertion terminated (4111 points created):<br>
> Info : - 0 Delaunay cavities modified for star shapeness<br>
> Info : - 0 points could not be inserted<br>
> Info : - 20740 tetrahedra created in 0.213642 sec. (97078 tets/sec.)<br>
> Info : Done meshing 3D (0.972973 s)<br>
> Info : 4112 vertices 24141 elements<br>
> Info : Building graph…<br>
> [1] 57253 segmentation fault (core dumped) gmsh -3 ./demos/sphere.geo -part 3<br>
><br>
> --<br>
> Docteur Ingénieur de recherche<br>
> CeMoSiS - <a href="mailto:vincent.huber@cemosis.fr">vincent.huber@cemosis.fr</a><br>
> Tel: <a href="tel:%2B33%20%280%293%2068%2085%2002%2006" value="+33368850206">+33 (0)3 68 85 02 06</a><br>
> IRMA - 7, rue René Descartes<br>
> 67 000 Strasbourg<br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> gmsh mailing list<br>
> <a href="mailto:gmsh@onelab.info">gmsh@onelab.info</a><br>
> <a href="http://onelab.info/mailman/listinfo/gmsh" rel="noreferrer" target="_blank">http://onelab.info/mailman/listinfo/gmsh</a><br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Prof. Christophe Geuzaine<br>
University of Liege, Electrical Engineering and Computer Science<br>
<a href="http://www.montefiore.ulg.ac.be/~geuzaine" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.montefiore.ulg.ac.be/~geuzaine</a><br>
<br>
Tetrahedron V, July 4-5 2016: <a href="http://tetrahedron.montefiore.ulg.ac.be" rel="noreferrer" target="_blank">http://tetrahedron.montefiore.ulg.ac.be</a><br>
Free software: <a href="http://gmsh.info" rel="noreferrer" target="_blank">http://gmsh.info</a> | <a href="http://getdp.info" rel="noreferrer" target="_blank">http://getdp.info</a> | <a href="http://onelab.info" rel="noreferrer" target="_blank">http://onelab.info</a><br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="courier new, monospace">Docteur Ingénieur de recherche</font><div><font face="courier new, monospace"><a href="http://www.cemosis.fr" target="_blank">CeMoSiS</a> - <a href="mailto:vincent.huber@cemosis.fr" target="_blank">vincent.huber@cemosis.fr</a></font></div><div><font face="courier new, monospace">Tel: +33 (0)3 68 8<b>5 02 06</b></font></div><div><font face="courier new, monospace">IRMA - 7, rue René Descartes</font></div><div><font face="courier new, monospace">67 000 Strasbourg</font></div><div><br></div><div><img src="http://www.google.com/a/cpanel/cemosis.fr/images/logo.gif"></div></div></div>
</div>