[Gmsh] gmsh et surface accessible pour des solvents

[Marino Vetuschi Zuccolini]

Bonjour a tous,

je m'occupe de calcul des proprietées thermodynamiques pour des  
solutes en solution dans l'eau parmi des calcules quantiques.  
Maintenant je vais à utiliser un logiciel qui simule l'eau de façon  
pas explicite mais avec la construction d'une surface à partir des  
rayon de Van der Waals pour les atomes.
A partir de la source du logiciel (gamess-us , qui fait les calcul) je  
suis capable de faire un'extraction des coordonées des vertex pour  
toutes le tesserae et d'écrire un fichier très simple de façon que  
gmsh est capable de le visualizer.
De cette maniére je suis capable de materialiser la géometrie de  
points où les sphéres vient a contact et donc où des artifacts peuvent  
donner de problèmes pur la distribution de la charge pendent les  
cycles iteratives.
J'aurai besoin de savoir quel peut etre la meilleur façon de  
representer la magnitude de la charge pour chaque tessera avec une  
échlle de couleurs arbitraire. Je connait aussi le point de la normale  
à la surface de la tessera...

Je vous remerci beaucoup pour votre logiciel et votre aide

marino



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Marino Vetuschi Zuccolini
zucco at dipteris.unige.it
Researcher / Geochemist
Laboratory of Geochemistry

DIPartimento per lo studio della TErra e delle sue RISorse -  
Università  di Genova
Tel. ++39 010 3538136 Fax. ++39 010 352169
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