[Gmsh] gmsh et surface accessible pour des solvents

Christophe Geuzaine cgeuzaine at ulg.ac.be
Wed Jan 30 08:50:55 CET 2008


Marino Vetuschi Zuccolini wrote:
> Bonjour a tous,
> 
> je m'occupe de calcul des proprietées thermodynamiques pour des  
> solutes en solution dans l'eau parmi des calcules quantiques.  
> Maintenant je vais à utiliser un logiciel qui simule l'eau de façon  
> pas explicite mais avec la construction d'une surface à partir des  
> rayon de Van der Waals pour les atomes.
> A partir de la source du logiciel (gamess-us , qui fait les calcul) je  
> suis capable de faire un'extraction des coordonées des vertex pour  
> toutes le tesserae et d'écrire un fichier très simple de façon que  
> gmsh est capable de le visualizer.
> De cette maniére je suis capable de materialiser la géometrie de  
> points où les sphéres vient a contact et donc où des artifacts peuvent  
> donner de problèmes pur la distribution de la charge pendent les  
> cycles iteratives.
> J'aurai besoin de savoir quel peut etre la meilleur façon de  
> representer la magnitude de la charge pour chaque tessera avec une  
> échlle de couleurs arbitraire. Je connait aussi le point de la normale  
> à la surface de la tessera...

I don't quite get what you want to do. Could you send a picture?



> 
> Je vous remerci beaucoup pour votre logiciel et votre aide
> 
> marino
> 
> 
> 
> *******************************************************
> Marino Vetuschi Zuccolini
> zucco at dipteris.unige.it
> Researcher / Geochemist
> Laboratory of Geochemistry
> 
> DIPartimento per lo studio della TErra e delle sue RISorse -  
> Università  di Genova
> Tel. ++39 010 3538136 Fax. ++39 010 352169
> Corso Europa 26, 16132 - Genova - Italy
> 
> 
> 
> _______________________________________________
> gmsh mailing list
> gmsh at geuz.org
> http://www.geuz.org/mailman/listinfo/gmsh
> 
> 


-- 
Prof. Christophe Geuzaine
University of Liege, Electrical Engineering and Computer Science
http://www.montefiore.ulg.ac.be/~geuzaine