[Gmsh] gmsh et surface accessible pour des solvents
Christophe Geuzaine
cgeuzaine at ulg.ac.be
Wed Jan 30 08:50:55 CET 2008
Marino Vetuschi Zuccolini wrote:
> Bonjour a tous,
>
> je m'occupe de calcul des proprietées thermodynamiques pour des
> solutes en solution dans l'eau parmi des calcules quantiques.
> Maintenant je vais à utiliser un logiciel qui simule l'eau de façon
> pas explicite mais avec la construction d'une surface à partir des
> rayon de Van der Waals pour les atomes.
> A partir de la source du logiciel (gamess-us , qui fait les calcul) je
> suis capable de faire un'extraction des coordonées des vertex pour
> toutes le tesserae et d'écrire un fichier très simple de façon que
> gmsh est capable de le visualizer.
> De cette maniére je suis capable de materialiser la géometrie de
> points où les sphéres vient a contact et donc où des artifacts peuvent
> donner de problèmes pur la distribution de la charge pendent les
> cycles iteratives.
> J'aurai besoin de savoir quel peut etre la meilleur façon de
> representer la magnitude de la charge pour chaque tessera avec une
> échlle de couleurs arbitraire. Je connait aussi le point de la normale
> à la surface de la tessera...
I don't quite get what you want to do. Could you send a picture?
>
> Je vous remerci beaucoup pour votre logiciel et votre aide
>
> marino
>
>
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> Marino Vetuschi Zuccolini
> zucco at dipteris.unige.it
> Researcher / Geochemist
> Laboratory of Geochemistry
>
> DIPartimento per lo studio della TErra e delle sue RISorse -
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Prof. Christophe Geuzaine
University of Liege, Electrical Engineering and Computer Science
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